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Como alternativa se pueden explorar bibliotecas peptidicas para identificar moleculas que interaccionan con secuencias proteicas de P1B2.

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En tales procedimientos, los peptidos que se unen a P1B2 se identifican explorando bibliotecas que codifican una coleccion controlada o aleatoria próstata anal to finger letras aminoacidos. Los peptidos codificados por las bibliotecas se expresan como proteinas de fusion de proteinas de revestimiento bacteriofago, las particulas de bacteriofago se exploran despues frente a la proteina o proteinas P1B2.

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En consecuencia, próstata anal to finger letras identifican de este modo peptidos que tienen una amplia diversidad de usos, tales como reactivos terapeuticos, de pronostico o de diagnostico, sin ninguna informacion anterior sobre la estructura del ligando o molecula receptora esperados. Como alternativa, se usan lineas celulares que expresan P1B2 para identificar interacciones proteina-proteina mediadas por P1B2.

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Tales interacciones pueden examinarse usando tecnicas de inmunoprecipitacion vease, por ejemplo, Hamilton B. La proteina P1B2 puede inmunoprecipitarse de lineas celulares que expresan P1B2 usando anticuerpos antiP1B2.

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Como alternativa, pueden usarse anticuerpos contra marcador His en una linea celular modificada por ingenieria genetica para que exprese fusiones de P1B2 y un marcador His vectores mencionados anteriormente. El complejo inmunoprecipitado puede examinarse con respecto a asociacion proteica por procedimientos tales como transferencia de Western, marcaje con 35S-metionina de proteinas, microsecuenciacion de proteinas, tincion próstata anal to finger letras plata y electroforesis en gel de dos dimensiones.

Pueden identificarse moleculas pequenas y ligandos que próstata anal to finger letras con P1B2 a traves de ensayos de exploracion relacionados.

Por ejemplo, pueden identificarse moleculas pequenas que interfieren con la funcion proteica, incluyendo moleculas que interfieren con la capacidad de P1B2 para mediar en la fosforilacion y desfosforilacion, interaccion con moleculas de ADN o ARN como un indicio de regulacion de ciclos celulares, senalizacion de segundo mensajero o tumorogenesis.

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De forma similar, se identifican moleculas pequenas que modulan el canal de iones relacionado próstata anal to finger letras P1B2, bomba proteica o funciones de comunicacion celular y se usan para tratar pacientes que tengan un cancer que exprese P1B2 vease, por ejemplo, Hille, B. Ademas, pueden identificarse ligandos que regulan la funcion de P1B2 basandose en su capacidad para unirse a P1B2 y activar una construccion indicadora.

Las celulas contienen adicionalmente un gen indicador, la expresion del cual esta condicionada por la proximidad de la primera y segunda proteinas de fusion entre si, un acontecimiento que próstata anal to finger letras produce solamente si el ligando hibrido se une a sitios diana en ambas proteinas hibridas.

Las celulas que expresan el gen indicador se seleccionan y se identifica la molecula pequena desconocida o el ligando desconocido.

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Este procedimiento proporciona un medio para identificar moduladores que activan o inhiben P1B2. Los inventores describen un procedimiento para explorar con respecto a una molecula que interacciona con una secuencia de aminoacidos de P1B2 mostrada en la Figura 2 o Figura 3, que comprende las etapas de poner en contacto una poblacion de moleculas con una secuencia de aminoacidos de P1B2, permitir que la poblacion de moleculas y la secuencia de aminoacidos de P1B2 interaccionen en condiciones que facilitan una interaccion, determinar la presencia de una molecula que interacciona con la secuencia próstata anal to finger letras aminoacidos de P1B2 y despues separar las moleculas que no interaccionan con la secuencia de aminoacidos de P1B2 de las moleculas que si.

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El procedimiento puede comprender adicionalmente purificar, caracterizar e identificar una molecula que interacciona con la secuencia de aminoacidos de P1B2. La molecula identificada puede usarse para modular una funcion realizada por P1B2.

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La secuencia de aminoacidos de P1B2 puede ponerse en contacto con una biblioteca de peptidos. Como se desvela en el presente documento, pueden usarse polinucleotidos, polipeptidos de P1B2, linfocitos T citotoxicos reactivos CTLlinfocitos T auxiliares reactivos HTL y anticuerpos anti-polipeptido en ensayos de diagnostico, próstata anal to finger letras y terapeuticos bien conocidos que examinan las afecciones asociadas con crecimiento.

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Puede hacerse una analogia de P1B2 con un antigeno asociado a prostata PSA, el marcador arquetipico que se ha usado por los facultativos medicos durante anos para identificar y controlar la presencia de cancer de prostata vease, por ejemplo, Merrill y col.

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Cancer Inst. Tambien se usan diversos otros marcadores de diagnostico en contextos similares incluyendo p53 y K-ras vease, por ejemplo, Tulchinsky y col. Por lo tanto, la presente divulgacion de polinucleotidos y polipeptidos de P1B2 asi como sondas polinucleotidicas de P1B2 y anticuerpos antiP1B2 usados para identificar la presencia de estas moleculas y sus propiedades permite que los expertos en la materia utilicen estas moleculas en procedimientos que son analogos a los usados, por ejemplo, en diversos ensayos de diagnostico dirigidos a examinar las condiciones asociadas con cancer.

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Los procedimientos de diagnostico tipicos que usan los polinucleotidos, polipeptidos linfocitos T sensibles a y anticuerpos de P1B2, son analogos a los procedimientos de ensayos de diagnostico bien establecidos que próstata anal to finger letras, por ejemplo, polinucleotidos, polipeptidos, linfocitos T sensibles a y anticuerpos de PSA.

Por ejemplo, igual que los polinucleotidos de PSA se usan como sondas por ejemplo en analisis de Northern, vease, por ejemplo, Sharief y col. Especificamente, debido a que las metastasis implican el próstata anal to finger letras de celulas de cancer de un organo de origen tal como el pulmon o la glandula prostatica etc.

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Por ejemplo, cuando se descubre que una muestra biologica de tejido que normalmente no contiene celulas que expresan P1B2 ganglio linfatico contiene celulas que expresan P1B2 tal como la expresion de P1B2 vista en LAPC4 y LAPC9, xenotrasplantes aislados de ganglio linfatico y metastasis de hueso, respectivamente, este hallazgo es indicativo de metastasis.

En tales ensayos, los expertos en la materia pueden desear adicionalmente generar pruebas complementarias de metastasis próstata anal to finger letras la muestra biologica con respecto a próstata anal to finger letras presencia de un segundo marcador restringido a tejido ademas de P1B2 tal como PSA, PSCA etc.

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Igual que los fragmentos polinucleotidicos y variantes polinucleotidicas de PSA los emplean los expertos en la materia para su uso en procedimientos para controlar PSA, los fragmentos polinucleotidicos y variantes polinucleotidicas de P1B2 se usan de una manera analoga. Ilustrando esto, los cebadores usados para amplificar por PCR un polinucleotido de PSA deben incluir menos de la secuencia de PSA próstata anal to finger letras para actuar en la reaccion en cadena de la polimerasa.

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En el contexto de tales reacciones de PCR, los expertos en la materia generalmente crean diversos diferentes fragmentos polinucleotidicos que pueden usarse como cebadores para amplificar diferentes partes de un polinucleotido de interes o para optimizar reacciones de amplificacion vease, por ejemplo, Caetano-Anolles, G.

Biotechniques 25 próstata anal to finger letras :; Robertson y col. Se proporciona una ilustracion adicional del uso de tales fragmentos en el Ejemplo 4, en el que se usa un fragmento polinucleotidico de P1B2 como una sonda para mostrar la expresion de ARN de P1B2 en celulas cancerosas.

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Ademas, se usan normalmente secuencias polinucleotidicas variantes como sondas y cebadores para los ARNm correspondientes en analisis de PCR y Northern vease, por ejemplo, Sawai y col. Los fragmentos y variantes polinucleotidicos son utiles en este contexto cuando son capaces de unirse a una secuencia polinucleotidica diana por ejemplo, un polinucleotido de P1B2 mostrado en la Figura 2 o variante del mismo en.

Ademas, los polipeptidos de PSA que contienen un epitopo que puede reconocerse por un próstata anal to finger letras o linfocito T que se une especificamente a ese epitopo se próstata anal to finger letras en procedimientos de control de PSA.

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Tambien pueden usarse fragmentos polipeptidicos de P1B2 y analogos o variantes polipeptidicas de una manera analoga. Esta practica de usar fragmentos polipeptidicos o variantes polipeptidicas para generar anticuerpos tales como anticuerpos o linfocitos T anti PSA es tipica en la tecnica usandose una amplia diversidad de sistemas tales como proteinas de fusion por los facultativos vease, por ejemplo, Current Protocols In Molecular Biology, Volumen 2, Unidad 16, Frederick M.

En este contexto, cada epitopo o epitopos actuan para proporcionar la arquitectura con la que un anticuerpo o linfocito T es reactivo. Por ejemplo puede ser preferible usar un polipeptido próstata anal to finger letras comprende uno de los motivos biologicos de P1B2 analizados en el presente documento próstata anal to finger letras una subsecuencia que porta motivo que se identifica facilmente por un experto en la materia basandose en motivos disponibles en la tecnica.

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Los fragmentos polipeptidicos, variantes o analogos son normalmente utiles en este contexto siempre que comprendan un epitopo capaz de generar un anticuerpo o linfocito T especifico para una secuencia polipeptidica diana por ejemplo un polipeptido de P1B2 mostrado en la Figura 3. Como se muestra en el presente documento, los polinucleotidos y polipeptidos de P1B2 asi próstata anal to finger letras las sondas polinucleotidicas de P1B2 y anticuerpos o linfocitos T antiP1B2 usados para identificar la presencia de estas moleculas muestran propiedades especificas que los hacen utiles en el diagnostico de canceres tales como los enumerados en la Tabla I.

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Se usan ensayos de diagnostico que miden la presencia de productos genicos de P1B2, para evaluar la presencia o aparicion de una enfermedad descrita en el presente documento, tal como cancer de prostata, para identificar pacientes para medidas preventivas o control adicional, como se ha hecho tan exitosamente con PSA.

Ademas, estos materiales satisfacen una necesidad de la tecnica de próstata anal to finger letras que próstata anal to finger letras caracteristicas similares o complementarias a PSA en situaciones en las que, por ejemplo, no puede realizarse un diagnostico definitivo de metastasis de origen prostatico basandose en un ensayo de PSA solamente vease, por ejemplo, Alanen y col.

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Finalmente, ademas de su uso en ensayos de diagnostico, los polinucleotidos de P1B2 desvelados en el presente documento tienen varias otras utilidades tales como su uso en la identificacion de anomalias cromosomicas asociadas a oncogenes en la region cromosomica en la que se mapea el gen de P1B2 vease Ejemplo 3 posteriormente.

Por otra parte, ademas de su uso en ensayos de diagnostico, las proteinas y polinucleotidos relacionados con P1B2 desvelados en el presente documento tiene otras utilidades tales como su uso en analisis forense de tejidos de origen desconocido vease, por ejemplo, Takahama K Forensic Sci Int 28 de junio de ; 80 : Adicionalmente, pueden usarse proteinas o polinucleotidos relacionados con P1B2 descritos en el presente documento para tratar una afeccion patologica caracterizada por la sobreexpresion de P1B2.

Por ejemplo, la secuencia de aminoacidos o acido nucleico de la Figura 2 o Figura 3, o fragmentos de una de ellas, puede usarse para generar una respuesta inmune a un antigeno de P1B2. Pueden usarse anticuerpos u otras próstata anal to finger letras que reaccionan con P1B2 para modular la funcion de esta molecula y de este modo próstata anal to finger letras un beneficio terapeutico.

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Para su uso en las aplicaciones de diagnostico y terapeuticas descritas en el presente documento, tambien se describen kits en el presente documento. Tales kits pueden comprender un próstata anal to finger letras, envase o recipiente que se compartimentaliza para recibir uno o mas recipientes tales como frascos, tubos y similares, comprendiendo cada uno de los recipientes uno de los elementos separados a usar en el procedimiento.

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Por ejemplo, el recipiente o recipientes pueden comprender una sonda que esta o puede estar marcada de forma detectable. Dicha sonda puede ser un anticuerpo o polinucleotido especifico para una proteina relacionada con P1B2 o un gen o mensaje de P1B2, respectivamente.

El kit puede incluir toda o parte de la secuencia de aminoacidos de la Figura 2 o Figura 3 o analogos de la misma, o una molecula de acido nucleico que codifique tales próstata anal to finger letras de aminoacidos. El kit normalmente comprendera el recipiente descrito anteriormente y uno o mas otros recipientes que comprenden materiales deseables desde un punto de vista comercial y de usuario, incluyendo tampones, diluyentes, filtros, agujas, jeringas y prospectos con instrucciones para su uso.

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Puede estar presente una etiqueta en el recipiente para indicar que la composicion se usa para una terapia o aplicacion no terapeutica especifica y tambien puede indicar instrucciones para uso in vivo o in vitro, tal como los descritos anteriormente. Diversos aspectos de la invencion se describen adicionalmente y se ilustran por medio de los varios ejemplos que siguen, ninguno de los próstata anal to finger letras se pretende que limite el alcance de la invencion.

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Se incluyeron en el conductor ADNc derivados de 10 tejidos normales.

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Se realizaron cinco reacciones de PCR primaria separadas para cada experimento. Los productos se agruparon y diluyeron con agua. La PCR 2 se realizo usando ciclos de 94 'C durante 10 segundos, 68 'C durante 30 segundos y 72 'C durante 1, 5 minutos.

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El alineamiento de las dos proteinas se muestra en la Figura 4. La secuencia proteica de P1B2 v.

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La localizacion cromosomica puede implicar genes en patogenesis de enfermedad. Debido a que el gen de P1B2 humano se mapea en el cromosoma 11p En particular, se han identificado diversas anomalias cromosomicas en 11p Cancer Res.

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En este contexto, estos polinucleotidos satisfacen una necesidad en la tecnica para expandir la sensibilidad de exploracion próstata anal to finger letras para identificar anomalias cromosomicas mas sutiles y menos habituales vease, por ejemplo, Evans y col.

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Los resultados muestran fuerte expresion de P1B2 en grupo de cancer de prostata pero no en grupo vital 1 y grupo vital 2.

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Las variantes de transcrito son variantes de ARNm maduro del mismo gen por transcripcion alternativa o corte y empalme alternativo. Los transcritos próstata anal to finger letras son transcritos del mismo gen que comienza la transcripcion en puntos diferentes. Las variantes de corte y empalme son variantes de ARNm con corte y empalme diferente del mismo transcrito en eucariotas, cuando se transcribe un gen multiexonico de ADN genomico, el ARN inicial se corta y empalma para producir ARNm funcional, próstata anal to finger letras solamente tiene exones y se usa para traduccion en una secuencia de aminoacidos.

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En consecuencia, un gen dado puede tener de cero a muchos transcritos alternativos y cada transcrito puede tener de cero a muchas variantes de corte y empalme. Las variantes de transcrito pueden codificar proteinas similares o próstata anal to finger letras con la misma o similar funcion o pueden codificar proteinas con diferentes funciones y pueden expresarse en el mismo tejido al mismo tiempo o en diferentes tejidos al mismo tiempo o en el mismo tejido a diferentes tiempos o en diferentes tejidos a diferentes tiempos.

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Las proteinas codificadas por variantes de transcrito pueden tener localizaciones celulares o. Se identifican variantes de transcrito por diversos procedimientos aceptados en la tecnica.

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Por ejemplo, se identifican transcritos alternativos y variantes de corte y empalme por experimentos de clonacion de longitud completa o mediante el uso de próstata anal to finger letras de EST y transcrito de longitud completa. En primer lugar, todas las EST humanas se agruparon en grupos que muestran identidad directa o indirecta entre si.

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En segundo lugar, las EST en el mismo grupo se agruparon adicionalmente en subgrupos y se ordenaron en una secuencia consenso. La secuencia del gen original se compara con la secuencia o secuencias consenso u otras secuencias de longitud completa.

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